Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933403O08RikF6UK53 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms