Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syngap1F6SEU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngap1F6SEU4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngap1F6SEU4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms