Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf165E9QAU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Rnf165E9QAU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rnf165E9QAU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf165E9QAU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms