Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cald1E9QA15 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cald1E9QA15 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms