Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930451I11RikE9Q9R3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms