Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC030500E9Q6W0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC030500E9Q6W0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC030500E9Q6W0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BC030500E9Q6W0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC030500E9Q6W0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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