Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ythdc1E9Q5K9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms