Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DspE9Q557 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DspE9Q557 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DspE9Q557 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms