Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17727E9Q4V7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17727E9Q4V7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms