Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5430401F13RikE9Q328 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430401F13RikE9Q328 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms