Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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