Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3893E9Q1I1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3893E9Q1I1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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