Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r68E9Q0V3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms