Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3095E9Q058 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3095E9Q058 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms