Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph10bE9PYQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms