Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3002E9PW72 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3002E9PW72 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms