Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc62E9PVD1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc62E9PVD1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms