Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FgaE9PV24 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FgaE9PV24 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms