Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC035044E0CXF8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms