Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wscd2D4PHA7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wscd2D4PHA7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms