Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930467E23RikD3Z1P8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms