Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc8D3YZV8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc8D3YZV8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms