Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc6D3YZP9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc6D3YZP9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms