Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip3B9EHT4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip3B9EHT4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms