Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20547B8JJN0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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