Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia1B2RXQ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia1B2RXQ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms