Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc11B2RXC1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms