Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp26c1B2RXA7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms