Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5483B2RV77 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5483B2RV77 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms