Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol7aB2RT54 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol7aB2RT54 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms