Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rrn3B2RS91 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrn3B2RS91 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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