Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms