Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp964B2RR88 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp964B2RR88 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp964B2RR88 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp964B2RR88 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp964B2RR88 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp964B2RR88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp964B2RR88 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms