Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf3B2RQG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms