Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mbd5B1AYB6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mbd5B1AYB6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms