Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpruB1AUH1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtpruB1AUH1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpruB1AUH1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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