Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms