Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grik3B1AS29 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms