Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp36B1AQJ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms