Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox1B1APN4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox1B1APN4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms