Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms