Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2A3KGV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms