Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc9bA3KGF9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms