Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plcb2A3KGF7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plcb2A3KGF7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plcb2A3KGF7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms