Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn3aA2ASI5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn3aA2ASI5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms