Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtf1A2AQ19 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtf1A2AQ19 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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