Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1aA2APX8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1aA2APX8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms