Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syndig1A2ANU3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms