Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brwd3A2AHJ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Brwd3A2AHJ4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brwd3A2AHJ4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Brwd3A2AHJ4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms