Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd4A2AFR3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms